https://frosthead.com

Første hvirveldyrart Beskrivelse med en DNA-stregkode

I december 1982 dykkede Benjamin Victor, grundlægger af koralrevforskningsinitiativet Ocean Science Foundation, i et rev lige offshore af en Smithsonian Tropical Research Institute feltstation, da han opsøgte en voksen goby. Fiskene lignede lidt forskelligt fra dens atlantiske klynger, men dens egenskaber var ikke unikke nok til at erklære den for en ny art.

Victor mistænkte, at forskellene løb dybt inde i gobys genetiske sammensætning, men artsidentifikationssystemet, der udelukkende var baseret på fysiske identifikatorer som markeringer, antal finner og knogler, svigtede ham. Han ville have brug for en anden prøve og DNA-analyse. Så prøven sad og sad - på Victor's skrivebord faktisk - i næsten 25 år.

I marts 2006 indsamlede Dave Jones fra National Marine Fisheries Service et larveeksempler, der minder om Victor's goby i en fælde ud af Mexicos Yucatan. Derfra tillader den nye taksonomiske stregkodningsteknik Victor at matche larvenes DNA med den voksnes og erklære gobyen som en ny art, en der afviger fra dens atlantiske goby-kina med hele 25 procent (husk: mennesker og chimpanser er kun 1-2 procent forskellige).

Fiskens påstand om berømmelse er, at dens identitet er blevet spikret af en DNA-stregkode. Stregkoden, der er taget fra en aftalte placering i genomet, fungerer som et forbrugerprodukts stregkode, idet den forsegler handlen med hensyn til identifikation.

Gobyen, der kaldes Coryphopterus kuna, er blevet den første hvirveldyrart, der har sin DNA-stregkode inkluderet i dens officielle artsbeskrivelse. Cirka 30.000 kendte arter, fra svampe til fugle, er blevet kodet, men i alle tilfælde blev arten fundet og videnskabeligt beskrevet inden stregkoderne blev oprettet. Barcode of Life-initiativet, hvor Smithsonian Institution er en partner, opfordrer indtrængende til, at de korte DNA-strenge indsamles og placeres i en open-access-database.

"Der var ingen måde at gøre det let og konsistent at identificere en fisk på. Man skulle normalt være en ekspert og skulle have et godt vokseneksemplar for at undersøge, og så var det din mening, " siger Victor fra taksonomi forud-stregkodning. "Nu kan enhver med adgang til stregkodningsteknologi sige med sikkerhed, sekvensen matcher arter X, selvom det, du har, er et æg, larve eller en skala eller et stykke hud."

(Med tilladelse fra STRI)

Første hvirveldyrart Beskrivelse med en DNA-stregkode