https://frosthead.com

Ambitiøst projekt til rækkefølge af gener på 1,5 millioner arter starter

Sidste uge lancerede et globalt konsortium af videnskabsmænd officielt Earth BioGenome-projektet. Som Kate Kelland hos Reuters rapporterer, kalder bagmændene det omfattende initiativ det næste ”moonshot for biologi.” Projekteret til at koste 4, 7 milliarder dollars, sigter det mod sekvensering af DNA fra de 1, 5 millioner kendte arter af eukaryotiske eller komplekse arter af liv på Jorden . At have et DNA-kort over så mange arter, siger forskere, vil genskabe det, vi ved om biologi, økologi og biodiversitet.

Ifølge en pressemeddelelse starter projektet med en ny indsats fra Wellcome Sanger Institute, kaldet Darwin Tree of Life-projektet, som sigter mod at sekvensere alle 66.000 eukaryote arter, der er fundet i Storbritannien i løbet af de næste ti år. I alt har 17 institutioner over hele kloden, inklusive Smithsonian, tilmeldt sig projektet og vil skitsere deres planer i den nærmeste fremtid.

I øjeblikket har forskere kun sekventeret genomerne på omkring 3.500 arter af komplekst liv, og kun ca. 100 er blevet sekventeret med "referencekvalitet", der bruges til dybdegående forskning. At tilføje titusinder af genomer til denne liste er intet mindre end revolutionerende.

”Vi taler om nye lægemidler, nye brændstoffer til fremtiden, ” siger Julia Wilson fra Sanger Trust til Victoria Gill på BBC. ”Vi er i øjeblikket begrænset af vores forestillinger - vi kan ikke engang forestille os, hvad dette ville fortælle os.”

Den ambitiøse idé kom først sammen i 2015 på et møde, der ledes af Harry A. Lewin, University of California, og Davis udmærkede professor i evolution og økologi; Gene Robinson, direktør for Carl R. Woese University of Illinois 'Institute for Genomic Biology; og W. John Kress, forskningsbotanist og kurator ved Smithsonian's National Museum of Natural History.

Forskerne blev inspireret af Human Genome Project. Mens den historiske sekventering af det menneskelige genom i 2003 havde taget over et årti at koste og koste omkring 3 milliarder dollars på det tidspunkt (hvilket, hvis man tager inflationen i betragtning, ville koste anslagsvis $ 5 milliarder dollars i døgnet), reducerede den enorme indsats dramatisk udgifter til sekventeringstjenester. Det sætter dette enorme projekt inden for muligheden.

Når det er afsluttet, antages det, at Earth BioGenome-projektet vil producere en exabyte af data eller 1 milliard gigabyte, som vil blive delt online gratis.

Det er svært at sige, hvad genkortlægningen vil føre til. ”Huller i vores viden er meget større end hvad vi ved, ” fortæller Lewin til BBC. ”Så vi udfylder ikke engang brikkerne i puslespillet; det meste af puslespillet er tomt. ”

Men som Jim Smith, direktør for videnskab hos Wellcome Trust, påpegede, at det samme var tilfældet, da forskerne først kom til at arbejde på Human Genome Project for et kvart århundrede siden. ”[W] e kunne ikke forestille sig, hvordan den DNA-sekvens, der blev produceret dengang, ville omdanne forskning til menneskers sundhed og sygdom i dag, ” siger Smith. ”At gå ud på en mission for at rækkefølge alt liv på Jorden er ikke anderledes.”

Ambitiøst projekt til rækkefølge af gener på 1,5 millioner arter starter